Jeg prøver at bruge HOMER til at lave en metagenprofil over genlegemer ved hjælp af en senggraffil, jeg har genereret. Problemet er, at hver gang jeg gør det, bliver jeg virkelig underlig skalering på y-aksen. Jeg skulle få gennemsnitsværdier på tværs af genlegemet i størrelsesordenen 5-10, men i stedet får jeg værdier i størrelsesordenen 0,03-0,05 eller derunder. Det underlige er, at når jeg ikke bruger metagene-script, eller når jeg ikke bruger histogram med -størrelse givet, får jeg helt normale værdier - men det er ikke, hvad jeg desværre vil have til metagene-profilen.
Hvad mangler jeg?