Jeg ved, at jeg kan bruge bcftools isec
til at sammenligne to VCF-filer, der indeholder enkeltnukleotidvarianter (SNV'er); det genererer fire mulige outputfiler: en med alle de unikke SNV'er i fil 1, en med alle de unikke SNV'er i fil 2, en med alle SNV'er fra fil 1, der også blev fundet i fil 2, og endelig en med alle SNV'erne fra fil 2, der også blev fundet i fil 1. Er der en lignende type værktøj, der gør det muligt at sammenligne strukturelle varianter (SV'er) mellem to VCF-filer? Jeg er ved at tilpasse et af mine Perl-scripts (der i øjeblikket bruger VCF.pm Perl-modulet til at parsere VCF-filer) for at udføre denne beregning (for hidtil har jeg ikke fundet nogen værktøjer designet til SV'er), men jeg troede, jeg ville spørge i dette forum, hvis nogen andre allerede har opfundet dette hjul.