Spørgsmål:
Hvad er en hurtig måde at finde det omvendte supplement i bash på
winni2k
2019-04-15 14:46:13 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Jeg har en DNA-sekvens, hvor jeg hurtigt vil finde det omvendte komplement. Er der en hurtig måde at gøre dette på bash-kommandolinjen udelukkende ved hjælp af GNU-værktøjer?

To svar:
winni2k
2019-04-15 14:46:13 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Tak til Manu Tamminen for denne løsning: 

  ekko ACCTTGAAA | tr ACGTacgt TGCAtgca | rev
Og hvis jeg vil sætte det i en variabel i stedet for at gentage det?
Jeg ville vedlægge koden i $ () og tildele en variabel, forudsat at du bruger en nyere version af bash.
det fungerer tak!
thomas duge de bernonville
2020-04-29 14:02:25 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Du kan enten installere emboss-pakken ( http://emboss.sourceforge.net/download/) og bruge revseq-programmet. Det indeholder mange nyttige kommandolinjeprogrammer, såsom parvis justering værktøjsnål.



ⓘ
Denne spørgsmål og svar blev automatisk oversat fra det engelske sprog.Det originale indhold er tilgængeligt på stackexchange, som vi takker for den cc by-sa 4.0-licens, den distribueres under.
Loading...