Hvad er forskellen mellem TPM og CPM, når du beskæftiger dig med RNA-seq-data?
Hvilke metrics vil du bruge, hvis du skal udføre en anden downstream-analyse end Differential udtryk for f.eks.
Klyngeanalyse ved hjælp af Hclust-funktionen og derefter plotte varmekort for at finde forskelle med hensyn til ekspressionsniveauer, korrelation og pca
Er det forkert at bruge TPM til en sådan analyse, hvis ja, når bruger man TPM versus CPM.